1）提高蔬菜產(chǎn)量。研究證明，微生物肥料提高蔬菜產(chǎn)量20%～40%，高的可達50%。但長(cháng)期以來(lái)，一些農業(yè)科技人員把微生物肥料在生產(chǎn)中的應用效果或者效應同化學(xué)肥料的標準作比較，如可替代化肥中多少營(yíng)養元素，如固氮菌替代多少氮素，    生物磷肥替代多少五氧化二磷，生物鉀肥替代多少氧化鉀。實(shí)際上微生物肥料的作用本質(zhì)與化學(xué)肥料大相徑庭，二者不在一個(gè)層面上，所以用同一標準衡量它們的效應是不合理的，微生物肥料不是單一的化學(xué)元素的效應，而是綜合效應

2）提高蔬菜品質(zhì)。使用微生物肥料可提高蔬菜的品質(zhì)，微生物對蔬菜中的蛋白質(zhì)、糖、維生素等成分的含量都有一定的改善，同時(shí)可減少硝酸鹽和重金屬的積累。

3）刺激蔬菜生長(cháng)。許多用微生物肥料生產(chǎn)的微生物種類(lèi)在生長(cháng)繁殖的過(guò)程中產(chǎn)生對植物有益的代謝產(chǎn)物，如赤霉素、吲哚乙酸、細胞分裂素、維生素和氨基酸等植物生長(cháng)調節劑刺激蔬菜生長(cháng)。

4）提高抗病害作用。利于防病、抗病，有的微生物種類(lèi)還能產(chǎn)生抗菌素類(lèi)物質(zhì)，有的則是由于在植物根區形成優(yōu)勢種群，使病原微生物難以生長(cháng)繁殖而降低了作物病蟲(chóng)害的發(fā)生。